سازمان مرجعیت در اسلام، با خاستگاه ولایت الهی ، دارای جایگاهی بس عظیم و رفیع است؛ زیرا مرجعیت در این نظام، استمرار و تداوم ولایت الهی معصومان است و فلسفه مشروعیت و مقبولیت آن در میان عامه مردم مسلمان نیز از همین منظر قابل توجیه و تبیین علمی است.

در ساختار نظام ولایی، مرجعیت دارای وظایف و تکالیف و نیز حقوقی است که می بایست دانسته و ارج نهاده شود؛ همان طوری که خدا فرمان می دهد تا در مسائل به ایشان به عنوان مرجع علمی مراجعه شود: فَاسْأَلُوا أَهْلَ الذِّکْرِ إِنْ کُنْتُمْ لَا تَعْلَمُونَ ، هم چنین در مسائل اجتماعی و دنیوی می بایست به عنوان پاسداران ولایت الهی از آنان اطاعت شود: یَا أَیُّهَا الَّذِینَ آمَنُوا أَطِیعُوا اللَّهَ وَأَطِیعُوا الرَّسُولَ وَأُولِی الْأَمْرِ مِنْکُمْ فَإِنْ تَنَازَعْتُمْ فِی شَیْءٍ فَرُدُّوهُ إِلَى اللَّهِ وَالرَّسُولِ إِنْ کُنْتُمْ تُؤْمِنُونَ بِاللَّهِ وَالْیَوْمِ الْآخِرِ ذَلِکَ خَیْرٌ وَأَحْسَنُ تَأْوِیلًا. چنان که لازم است تا از ایشان به عنوان پناهگاه امن الهی بهره گرفته شود: وَإِذَا جَاءَهُمْ أَمْرٌ مِنَ الْأَمْنِ أَوِ الْخَوْفِ أَذَاعُوا بِهِ وَلَوْ رَدُّوهُ إِلَى الرَّسُولِ وَإِلَى أُولِی الْأَمْرِ مِنْهُمْ.

از نظر ساختار نظام ولایی، مراجع عظام تقلید به عنوان امنای الهی می بایست مورد اطاعت قرار گیرند و در حوادث روزگار از آنان دستورالعمل گرفته و اطاعت شود؛ چرا که « الفقهاء أمناء الرسل» و « الْفُقَهَاءَ حُصُونُ الْإِسْلَامِ» هستند؛ و در توقیع شریف از مقام حضرت امام زمان عجل الله تعالی فرجه الشریف نیز آمده است: امّا الحوادِثُ الواقعة فارجعوا فیها الى رُواةِ حدیثنا فَأِنَّهم حُجّتى علیکُم و انا حجّة الله علیهم»؛ «در رخدادهایى که اتفاق مى?افتد، به راویان حدیث ما مراجعه کنید؛ زیرا آنان حجّت من بر شمایند و من حجت خدا بر آنان هستم».

امام حسن عسکری(ع) نیز در تبیین جایگاه رفیع مراجع عظام می فرماید: فَأمّا مَن کانَ مِن الفُقَهاءِ صائنا لنفسِهِ حافِظا لِدینِهِ مُخالِفا على هَواهُ مُطِیعا لأمرِ مَولاهُ فلِلعَوامِّ أن یُقَلِّدُوهُ.

بنابراین، بر اساس آیات و روایات متواتر لفظی و معنوی لازم است تا از این جایگاه صیانت شود و کسی متعرض آن نشود و کرامت نهاد و مقام حفاظت و از هر گونه اهانت پرهیز شود.

حوزه های علمیه هماره در سایه مرجعیت به بالندگی رسیده و امور امت اسلام در پرتو انوار مراجع سامان یافته و انقلاب اسلامی از این شجره طیبه بهره مند شده و به بلوغ کنونی خویش رسیده است که بستر ساز ظهور منجی بشریت حضرت صالح مصلح مهدی امت(عج) می شود.

امروز صیانت از جایگاه مرجعیت به معنا و مفهوم حمایت و صیانت از اصل اسلام و ولایت الهی و استمرار بخشی به آن است و هر گونه تعرض به هر بهانه و توجیه غیر قابل گذشت است.